TY - JOUR AU - Jensen, L. J. AU - Saric, J. AU - Bork, P. PY - 2006 DA - 2006// TI - Literature mining for the biologist: from information retrieval to biological discovery JO - Nat Rev Genet VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/nrg1768 DO - 10.1038/nrg1768 ID - Jensen2006 ER - TY - JOUR AU - Katsila, T. AU - Patrinos, G. P. PY - 2015 DA - 2015// TI - Whole genome sequencing in pharmacogenomics JO - Front Pharmacol VL - 6 UR - https://doi.org/10.3389/fphar.2015.00061 DO - 10.3389/fphar.2015.00061 ID - Katsila2015 ER - TY - JOUR AU - Belinky, F. AU - Bahir, I. AU - Stelzer, G. AU - Zimmerman, S. AU - Rosen, N. AU - Nativ, N. AU - Dalah, I. AU - Iny Stein, T. AU - Rappaport, N. AU - Mituyama, T. PY - 2013 DA - 2013// TI - Non-redundant compendium of human ncRNA genes in GeneCards JO - Bioinformatics VL - 29 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bts676 DO - 10.1093/bioinformatics/bts676 ID - Belinky2013 ER - TY - JOUR AU - Stelzer, G. AU - Dalah, I. AU - Stein, T. I. AU - Satanower, Y. AU - Rosen, N. AU - Nativ, N. AU - Oz-Levi, D. AU - Olender, T. AU - Belinky, F. AU - Bahir, I. PY - 2011 DA - 2011// TI - In-silico human genomics with GeneCards JO - Hum Genom VL - 5 UR - https://doi.org/10.1186/1479-7364-5-6-709 DO - 10.1186/1479-7364-5-6-709 ID - Stelzer2011 ER - TY - JOUR AU - Safran, M. AU - Dalah, I. AU - Alexander, J. AU - Rosen, N. AU - Iny Stein, T. AU - Shmoish, M. AU - Nativ, N. AU - Bahir, I. AU - Doniger, T. AU - Krug, H. PY - 2010 DA - 2010// TI - GeneCards version 3: the human gene integrator JO - Database (Oxford) VL - 2010 UR - https://doi.org/10.1093/database/baq020 DO - 10.1093/database/baq020 ID - Safran2010 ER - TY - JOUR AU - Rappaport, N. AU - Twik, M. AU - Plaschkes, I. AU - Nudel, R. AU - Iny Stein, T. AU - Levitt, J. AU - Gershoni, M. AU - Morrey, C. P. AU - Safran, M. AU - Lancet, D. PY - 2017 DA - 2017// TI - MalaCards: an amalgamated human disease compendium with diverse clinical and genetic annotation and structured search JO - Nucleic Acids Res VL - 45 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkw1012 DO - 10.1093/nar/gkw1012 ID - Rappaport2017 ER - TY - JOUR AU - Stelzer, G. AU - Rosen, N. AU - Plaschkes, I. AU - Zimmerman, S. AU - Twik, M. AU - Fishilevich, S. AU - Stein, T. I. AU - Nudel, R. AU - Lieder, I. AU - Mazor, Y. AU - Kaplan, S. AU - Dahary, D. AU - Warshawsky, D. AU - Guan-Golan, Y. AU - Kohn, A. AU - Rappaport, N. AU - Safran, M. AU - Lancet, D. PY - 2016 DA - 2016// TI - The GeneCards suite: from gene data mining to disease genome sequence analyses JO - Curr Protoc Bioinf. VL - 54 UR - https://doi.org/10.1002/cpbi.5 DO - 10.1002/cpbi.5 ID - Stelzer2016 ER - TY - JOUR AU - Belinky, F. AU - Nativ, N. AU - Stelzer, G. AU - Zimmerman, S. AU - Iny Stein, T. AU - Safran, M. AU - Lancet, D. PY - 2015 DA - 2015// TI - PathCards: multi-source consolidation of human biological pathways JO - Database (Oxford) VL - 2015 UR - https://doi.org/10.1093/database/bav006 DO - 10.1093/database/bav006 ID - Belinky2015 ER - TY - JOUR AU - Rosen, N. AU - Chalifa-Caspi, V. AU - Shmueli, O. AU - Adato, A. AU - Lapidot, M. AU - Stampnitzky, J. AU - Safran, M. AU - Lancet, D. PY - 2003 DA - 2003// TI - GeneLoc: exon-based integration of human genome maps JO - Bioinformatics VL - 19 UR - https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btg1030 DO - 10.1093/bioinformatics/btg1030 ID - Rosen2003 ER - TY - JOUR AU - Buzhor, E. AU - Leshansky, L. AU - Blumenthal, J. AU - Barash, H. AU - Warshawsky, D. AU - Mazor, Y. AU - Shtrichman, R. PY - 2014 DA - 2014// TI - Cell-based therapy approaches: the hope for incurable diseases JO - Regen Med VL - 9 UR - https://doi.org/10.2217/rme.14.35 DO - 10.2217/rme.14.35 ID - Buzhor2014 ER - TY - JOUR AU - Stelzer, G. AU - Plaschkes, I. AU - Oz-Levi, D. AU - Alkelai, A. AU - Olender, T. AU - Zimmerman, S. AU - Twik, M. AU - Belinky, F. AU - Fishilevich, S. AU - Nudel, R. PY - 2016 DA - 2016// TI - VarElect: the phenotype-based variation prioritizer of the GeneCards suite JO - BMC Genom VL - 17 UR - https://doi.org/10.1186/s12864-016-2722-2 DO - 10.1186/s12864-016-2722-2 ID - Stelzer2016 ER - TY - JOUR AU - Ben-Ari Fuchs, S. AU - Lieder, I. AU - Stelzer, G. AU - Mazor, Y. AU - Buzhor, E. AU - Kaplan, S. AU - Bogoch, Y. AU - Plaschkes, I. AU - Shitrit, A. AU - Rappaport, N. PY - 2016 DA - 2016// TI - GeneAnalytics: an integrative gene set analysis tool for next generation sequencing, RNAseq and microarray data JO - OMICS VL - 20 UR - https://doi.org/10.1089/omi.2015.0168 DO - 10.1089/omi.2015.0168 ID - Ben-Ari Fuchs2016 ER - TY - JOUR AU - Stelzer, G. AU - Inger, A. AU - Olender, T. AU - Iny-Stein, T. AU - Dalah, I. AU - Harel, A. AU - Safran, M. AU - Lancet, D. PY - 2009 DA - 2009// TI - GeneDecks: paralog hunting and gene-set distillation with GeneCards annotation JO - OMICS VL - 13 UR - https://doi.org/10.1089/omi.2009.0069 DO - 10.1089/omi.2009.0069 ID - Stelzer2009 ER - TY - JOUR AU - Rappaport, N. AU - Nativ, N. AU - Stelzer, G. AU - Twik, M. AU - Guan-Golan, Y. AU - Stein, T. I. AU - Bahir, I. AU - Belinky, F. AU - Morrey, C. P. AU - Safran, M. AU - Lancet, D. PY - 2013 DA - 2013// TI - MalaCards: an integrated compendium for diseases and their annotation JO - Database (Oxford) VL - 2013 UR - https://doi.org/10.1093/database/bat018 DO - 10.1093/database/bat018 ID - Rappaport2013 ER - TY - JOUR AU - Rappaport, N. AU - Twik, M. AU - Nativ, N. AU - Stelzer, G. AU - Bahir, I. AU - Stein, T. I. AU - Safran, M. AU - Lancet, D. PY - 2014 DA - 2014// TI - MalaCards: a comprehensive automatically-mined database of human diseases JO - Curr Protoc Bioinformatics VL - 47 ID - Rappaport2014 ER - TY - JOUR AU - Oz-Levi, D. AU - Ben-Zeev, B. AU - Ruzzo, E. K. AU - Hitomi, Y. AU - Gelman, A. AU - Pelak, K. AU - Anikster, Y. AU - Reznik-Wolf, H. AU - Bar-Joseph, I. AU - Olender, T. PY - 2012 DA - 2012// TI - Mutation in TECPR2 reveals a role for autophagy in hereditary spastic paraparesis JO - Am J Hum Genet VL - 91 UR - https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2012.09.015 DO - 10.1016/j.ajhg.2012.09.015 ID - Oz-Levi2012 ER - TY - JOUR AU - Oz-Levi, D. AU - Weiss, B. AU - Lahad, A. AU - Greenberger, S. AU - Pode-Shakked, B. AU - Somech, R. AU - Olender, T. AU - Tatarsky, P. AU - Marek-Yagel, D. AU - Pras, E. PY - 2015 DA - 2015// TI - Exome sequencing as a differential diagnosis tool: resolving mild trichohepatoenteric syndrome JO - Clin Genet VL - 87 UR - https://doi.org/10.1111/cge.12494 DO - 10.1111/cge.12494 ID - Oz-Levi2015 ER - TY - JOUR AU - Ruzzo, E. K. AU - Capo-Chichi, J. M. AU - Ben-Zeev, B. AU - Chitayat, D. AU - Mao, H. AU - Pappas, A. L. AU - Hitomi, Y. AU - Lu, Y. F. AU - Yao, X. AU - Hamdan, F. F. PY - 2013 DA - 2013// TI - Deficiency of asparagine synthetase causes congenital microcephaly and a progressive form of encephalopathy JO - Neuron VL - 80 UR - https://doi.org/10.1016/j.neuron.2013.08.013 DO - 10.1016/j.neuron.2013.08.013 ID - Ruzzo2013 ER - TY - JOUR AU - Alkelai, A. AU - Olender, T. AU - Haffner-Krausz, R. AU - Tsoory, M. M. AU - Boyko, V. AU - Tatarskyy, P. AU - Gross-Isseroff, R. AU - Milgrom, R. AU - Shushan, S. AU - Blau, I. PY - 2016 DA - 2016// TI - A role for TENM1 mutations in congenital general anosmia JO - Clin Genet VL - 90 UR - https://doi.org/10.1111/cge.12782 DO - 10.1111/cge.12782 ID - Alkelai2016 ER - TY - JOUR AU - Cooper, G. M. AU - Goode, D. L. AU - Ng, S. B. AU - Sidow, A. AU - Bamshad, M. J. AU - Shendure, J. AU - Nickerson, D. A. PY - 2010 DA - 2010// TI - Single-nucleotide evolutionary constraint scores highlight disease-causing mutations JO - Nat Methods VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/nmeth0410-250 DO - 10.1038/nmeth0410-250 ID - Cooper2010 ER - TY - JOUR AU - Uetz, P. AU - Giot, L. AU - Cagney, G. AU - Mansfield, T. A. AU - Judson, R. S. AU - Knight, J. R. AU - Lockshon, D. AU - Narayan, V. AU - Srinivasan, M. AU - Pochart, P. PY - 2000 DA - 2000// TI - A comprehensive analysis of protein-protein interactions in Saccharomyces cerevisiae JO - Nature VL - 403 UR - https://doi.org/10.1038/35001009 DO - 10.1038/35001009 ID - Uetz2000 ER - TY - JOUR AU - Gavin, A. C. AU - Bosche, M. AU - Krause, R. AU - Grandi, P. AU - Marzioch, M. AU - Bauer, A. AU - Schultz, J. AU - Rick, J. M. AU - Michon, A. M. AU - Cruciat, C. M. PY - 2002 DA - 2002// TI - Functional organization of the yeast proteome by systematic analysis of protein complexes JO - Nature VL - 415 UR - https://doi.org/10.1038/415141a DO - 10.1038/415141a ID - Gavin2002 ER - TY - JOUR AU - Giot, L. AU - Bader, J. S. AU - Brouwer, C. AU - Chaudhuri, A. AU - Kuang, B. AU - Li, Y. AU - Hao, Y. L. AU - Ooi, C. E. AU - Godwin, B. AU - Vitols, E. PY - 2003 DA - 2003// TI - A protein interaction map of Drosophila melanogaster JO - Science VL - 302 UR - https://doi.org/10.1126/science.1090289 DO - 10.1126/science.1090289 ID - Giot2003 ER - TY - JOUR AU - Bader, G. D. AU - Cary, M. P. AU - Sander, C. PY - 2006 DA - 2006// TI - Pathguide: a pathway resource list JO - Nucleic Acids Res VL - 34 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkj126 DO - 10.1093/nar/gkj126 ID - Bader2006 ER - TY - JOUR AU - Carithers, L. J. AU - Ardlie, K. AU - Barcus, M. AU - Branton, P. A. AU - Britton, A. AU - Buia, S. A. AU - Compton, C. C. AU - DeLuca, D. S. AU - Peter-Demchok, J. AU - Gelfand, E. T. PY - 2015 DA - 2015// TI - A novel approach to high-quality postmortem tissue procurement: the GTEx project JO - Biopreserv Biobank VL - 13 UR - https://doi.org/10.1089/bio.2015.0032 DO - 10.1089/bio.2015.0032 ID - Carithers2015 ER - TY - JOUR AU - Fishilevich, S. AU - Zimmerman, S. AU - Kohn, A. AU - Iny Stein, T. AU - Olender, T. AU - Kolker, E. AU - Safran, M. AU - Lancet, D. PY - 2016 DA - 2016// TI - Genic insights from integrated human proteomics in GeneCards JO - Database VL - 2016 UR - https://doi.org/10.1093/database/baw030 DO - 10.1093/database/baw030 ID - Fishilevich2016 ER - TY - JOUR AU - Zerbino, D. R. AU - Wilder, S. P. AU - Johnson, N. AU - Juettemann, T. AU - Flicek, P. R. PY - 2015 DA - 2015// TI - The ensembl regulatory build JO - Genome Biol VL - 16 UR - https://doi.org/10.1186/s13059-015-0621-5 DO - 10.1186/s13059-015-0621-5 ID - Zerbino2015 ER - TY - JOUR AU - Fishilevich, S. AU - Nudel, R. AU - Rappaport, N. AU - Hadar, R. AU - Plaschkes, I. AU - Stein, T. I. AU - Rosen, N. AU - Kohn, A. AU - Twik, M. AU - Safran, M. AU - Lancet, D. AU - Cohen, D. PY - 2017 DA - 2017// TI - GeneHancer: genome-wide integration of enhancers and target genes in GeneCards JO - Database VL - 2017 UR - https://doi.org/10.1093/database/bax028 DO - 10.1093/database/bax028 ID - Fishilevich2017 ER - TY - JOUR AU - Pletscher-Frankild, S. AU - Palleja, A. AU - Tsafou, K. AU - Binder, J. X. AU - Jensen, L. J. PY - 2015 DA - 2015// TI - Diseases: text mining and data integration of disease-gene associations JO - Methods VL - 74 UR - https://doi.org/10.1016/j.ymeth.2014.11.020 DO - 10.1016/j.ymeth.2014.11.020 ID - Pletscher-Frankild2015 ER - TY - JOUR AU - Jacomy, M. AU - Venturini, T. AU - Heymann, S. AU - Bastian, M. PY - 2014 DA - 2014// TI - ForceAtlas2, a continuous graph layout algorithm for handy network visualization designed for the Gephi software JO - PLoS ONE VL - 9 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0098679 DO - 10.1371/journal.pone.0098679 ID - Jacomy2014 ER -